L’analyse quantitative de la réaction en chaîne par polymérase en temps reel indique que l’ARNm duMDA5 est à peine détecté dans les tissus sains, et le plus grand niveau relatif de transcription duMDA5 a été induit pendant la stimulation poly(I:C). L’analyse phylogénétique a démontré que MDA5 a été fortement conservé lors de toute l’évolution des vertébrés. De multiples alignements de séquence ont montré que duMDA5 a une similarité de séquence d’acides aminés de 91,18 % et 83,11 % avec le gène MDA5 d’oie et de poulet, respectivement, et une identité de séquence de 59,76 % à 61,26 % avec les homologues de mammifères. Le cDNA consistait d’une région non traduite (UTR - « untranslated region ») 5′ de 123 nucléotides, d’une UTR 3′ de 735 nucléotides, et d’une phase ouverte de lecture de 3012 nucléotides, codant 1003 acides aminés. Dans cette étude, l’ADN complémentaire (cDNA - « complementary DNA ») pleine longueur duMDA5 a été obtenu au moyen de la transcription inverse-réaction en chaîne par polymérase et l’amplification rapide des bouts de cDNA. L’objectif de la présente étude était de caractériser la structure et la fonction du gène MDA5 chez le canard ( duMDA5 - « duck MDA5 »). Le gène 5 associé à la différenciation du mélanome (MDA5 - « melanoma differentiation-associated gene 5 ») est un détecteur important d’ARN cytoplasmique qui détecte l’ARN double-brin viral lors de l’immunité innée. Taken together, these results suggest that duMDA5 is an important receptor for inducing antiviral activity in the duck’s innate immune response. Furthermore, knockdown duMDA5 significantly inhibited the transcription of poly(I:C)-induced beta interferons, nuclear factor kappa-B, interferon regulatory factor 7, translocated intimin receptor domain-containing adaptor protein inducing beta interferons, interferon-induced GTP-binding protein, signal transducer and activator of transcription 1 and 2 mRNA. Quantitative real-time polymerase chain reaction analysis indicated that the duMDA5 mRNA is scarcely detected in healthy tissues and the highest relative transcript level of duMDA5 was induced during poly(I:C) stimulation. Phylogenetic analysis demonstrated that MDA5 has been highly conserved throughout vertebrate evolution. Multiple sequence alignments showed that duMDA5 had 91.18% and 83.11% amino acid sequence similarity with geese and chicken MDA5, respectively, as well as 59.76%–61.26% sequence identity with mammalian homologs. The cDNA consisted of a 123 nucleotide 5′ untranslated region (UTR), a 735 nucleotide 3′ UTR, and a 3012 nucleotide open-reading frame, encoding 1003 amino acids. In this study, full-length duck MDA5 ( duMDA5) complementary DNA (cDNA) was obtained using the reverse transcription-polymerase chain reaction and rapid amplification of the cDNA ends. The objective of this study was to characterize the structure and function of the MDA5 gene in the duck. Melanoma differentiation-associated gene 5 (MDA5) is an important cytoplasmic RNA sensor that detects viral double-stranded RNA in innate immunity.
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